Учреждение было открыто в июне 1979 года. Фонды музея составляют более 7000 единиц хранения. Коллекция большей частью состоит из предметов быта и культуры юганских ханты.

Основатель музея Петр Семенович Бахлыков увлекся краеведением в конце 1960-х – начале 1970-х гг. Один из первых в Сургутском районе он постарался собрать и сохранить исчезающие элементы хантыйской культуры. Многочисленные экспедиции по юртам позволили ему собрать богатейшую коллекцию предметов быта и музыкальных инструментов юганских ханты. Этнография юганских ханты и живопись Петра Семеновича на протяжении трех десятилетий были приоритетными при формировании фондов музея. На сегодняшний день этнографическая коллекция Угутского музея, пусть и не многочисленная, является наиболее полной коллекцией предметов быта юганской группы восточных ханты. Интерес представляет и небольшая коллекция археологии, представленная изделиями из металла XIV – XVII вв, и керамикой IV – XIII вв. н.э.